- عنوان کتاب: TRANSCRIPTOME PROFILING
- نویسنده: M. Ajmal Ali, Joongku Lee
- حوزه: ژنتیک
- سال انتشار: 2023
- تعداد صفحه: 530
- زبان اصلی: انگلیسی
- نوع فایل: pdf
- حجم فایل: 10.2 مگابایت
محتوای ژنتیکی یک موجود زنده در DNA ژنوم آن ذخیره می شود و از طریق فرآیندی به نام رونویسی بیان می شود. ترانسکریپتوم، کل مجموعه رونوشت ها در یک ارگانیسم یا تک سلولی در یک مرحله فیزیولوژیکی یا پاتولوژیک خاص، برای درک ارتباط و تنظیم بین DNA و پروتئین ضروری است. بنابراین یک رونوشت یک عکس فوری در زمان از کل رونوشت های موجود در یک سلول می گیرد. پیشرفت سریع پلتفرمهای توالییابی نسل بعدی، ابزارهای بیوانفورماتیک مانند محاسبات ابری، و پروفایلسازی و مطالعات رونویسی سطح عمیقتر، درک ما از نقشهبرداری ژن مبتنی بر RNA و شبکههای نظارتی را بهبود بخشیده است. تجزیه و تحلیل رونویسی مطالعه چگونگی تغییر بیان ژن در ارگانیسمهای مختلف را امکانپذیر کرده است و در درک بیماریهای انسانی، مسیرهای سیگنالی تنظیمکننده رشد اولیه جنین، ایمنی دارو یا ارزیابی خطر شیمیایی، و روابط فیلوژنتیکی بین افراد مفید بوده است. علاوه بر این، یکی از جدی ترین مسائل جهان، بحران غذایی کنونی است. استفاده از دستکاری ژنتیکی و اصلاح مولکولی در علوم گیاهی، به طور کلی، و کشاورزی و صنایع غذایی به طور خاص، سهم جذاب و بالقوه ای در بهبود عملکرد، کیفیت تغذیه ای غذاهای گیاهی و داروها است. پیشرفت های اخیر در omics مانند ژنومیکس، پروتئومیکس، متابولومیک، متاژنومیکس، و ترانسکریپتومیکس، پتانسیل را برای سرعت بخشیدن به روند توسعه محصولات با ویژگی های کشاورزی امیدوارکننده (مانند محصولات متحمل به فلزات سنگین، گونه های جدید محصولات پرمحصول و مقاوم به تنش) ارائه می دهد. ) در مقایسه با رویکرد سخت و پر زحمت اصلاح نباتات مرسوم. علیرغم چشماندازهای جذاب بسیاری که توسط توالیسازی رونوشت بر روی پلتفرمهای نسل بعدی ارائه میشود، هنوز هم، توسعه فناوریهای توالییابی و ابزارهای محاسباتی مناسب برای پردازش مؤثر مقادیر عظیمی از دادههای دنبالهای همچنان باعث ایجاد مجموعهای از پیشرفتهای رونوشتشناسی تا به امروز میشود. کتاب حاضر در مورد پروفایل رونویسی: پیشرفت و چشم انداز منبعی است برای علاقه مندان به ابزارها و تکنیک های مورد استفاده در رونوشت شناسی، خصوصیات رونویسی، تجزیه و تحلیل بیان رونوشت ها، رونوشت و تنظیم ژن، پروفایل رونوشت و سلامت انسان، ترانس کریپتومیکس گیاهان دارویی، ترانس کریپتومیکس و ژنتیک. مهندسی و رونویسی در کشاورزی مثل همیشه باید از دخترم هیبا علی و همسرم صبیحا علی اجمل به خاطر حمایت بی دریغشان در تصمیم گیری برای گذراندن عصرها و تعطیلات آخر هفته ام بر روی این کتاب و دیگر کتاب ها تشکر کنم.
The genetic content of an organism is stored in the DNA of its genome and expressed through the process known as transcription. Transcriptome, the entire pool of transcripts in an organism or single cell at a certain physiological or pathological stage, is indispensable for understanding the association and regulation between DNA and protein; thus a transcriptome captures a snapshot in time of the total transcripts present in a cell. The rapid advancement of next-generation sequencing platforms, bioinformatics tools such as cloud computing, and deeper level transcriptome profiling and studies has improved our understanding of RNAbased gene mapping and regulatory networks. The transcriptomic analysis has enabled the study of how gene expression changes in different organisms and has been instrumental in the understanding of human diseases, signaling pathways regulating early embryonic development, drug safety or chemical risk assessment, and phylogenetic relationships among individuals. Furthermore, one of the world’s most serious issues is the current food crisis. The use of genetic manipulation and molecular breeding in plant science, in general, and agriculture and the food industry in particular, is an attractive and potential contribution to improving the yield, nutritional quality of plant-based foods, and medicines. The recent advances in omics such as genomics, proteomics, metabolomics, metagenomics, and transcriptomics offer the potential to speed up the process of developing crops with promising agricultural traits (e.g., heavy metal-tolerant crops, new high yielding, stress-tolerant crop varieties) compared to difficult and laborious conventional plant breeding approach. Despite the many attractive prospects offered by transcriptome sequencing on next-generation platforms, still, the development in sequencing technologies and suitable computational tools to effectively process massive amounts of sequence data continues to prompt a compilation of transcriptomics progress to date. The present book on Transcriptome Profiling: Progress and Prospects is a resource for those interested in tools and techniques used in transcriptomics, transcriptome characterization, expression analysis of transcripts, transcriptome and gene regulation, transcriptome profiling and human health, medicinal plant transcriptomics, transcriptomics and genetic engineering, and transcriptomics in agriculture. As always, I must also thank my daughter Hiba Ali and wife Sabiha Ali Ajmal for their unwavering support in the decision to spend my evenings and weekends working on this and other books.
این کتاب را میتوانید بصورت رایگان از لینک زیر دانلود نمایید.
Download: TRANSCRIPTOME PROFILING
نظرات کاربران