- عنوان کتاب: Bioinformatics with Python Cookbook -Solve advanced computational biology problems and build production pipelines with Python
- نویسنده: Shane Brubaker
- حوزه: برنامهنویسی پایتون
- سال انتشار: 2025
- تعداد صفحه: 596
- زبان اصلی: انگلیسی
- نوع فایل: pdf
- حجم فایل: 42.3 مگابایت
بیوانفورماتیک یک حوزه فوقالعاده متحولکننده است که در این دوره از علم محاسباتی، توجه روزافزونی را به خود جلب میکند. از روزهای اولیه توسعه اولین اطلسهای توالی و ابزارهای همترازی تا هیجان پروژه ژنوم انسان، بیوانفورماتیک همواره یک حوزه بسیار میانرشتهای بوده است. این حوزه، علاقهمندان به استفاده از محاسبات برای پیشرفت علم به روشهایی که قبلاً هرگز قابل دستیابی نبود را به خود جذب میکند. این کتاب به شما روشهای عملی برای حل مسائل دنیای واقعی در بیوانفورماتیک را آموزش میدهد. ما تمام مباحث اصلی در بیوانفورماتیک را پوشش خواهیم داد تا پایه محکمی در هر زمینه به شما بدهیم. این کتاب با استفاده از پایتون، که به زبان غالب در بیوانفورماتیک تبدیل شده است، تدریس خواهد شد. در هر دستور العمل، کتابخانههای مهم پایتون و تکنیکهای برنامهنویسی مورد استفاده برای حل مسائل مربوطه را به شما نشان خواهیم داد و منابع فراوانی را برای یادگیری بیشتر و رشد مهارتهایتان در اختیار شما قرار خواهیم داد. ما با مقدمهای مختصر در مورد پایتون و تکنیکهای اولیه پردازش دادهها و علوم داده شروع خواهیم کرد. سپس الگوریتمهای اصلی در بیوانفورماتیک را برای همترازی ژنوم، مونتاژ، حاشیهنویسی و فراخوانی متغیر پوشش خواهیم داد. در مرحله بعد، به بررسی گنجینه پایگاههای داده عمومی موجود برای دادههای بیوانفورماتیک خواهیم پرداخت و نحوه پیمایش آنها را یاد خواهیم گرفت. سپس کاربردهای مهم بیوانفورماتیک، مانند فیلوژنتیک، مدلسازی متابولیک و ویرایش ژنوم را پوشش خواهیم داد. مقدمهای جامع در مورد محاسبات ابری به شما ارائه خواهیم داد و سیستمهای اصلی گردش کار در بیوانفورماتیک را که برای هماهنگسازی خطوط لوله پیچیده استفاده میشوند، پوشش خواهیم داد. در نهایت، در مورد تأثیر رو به رشد یادگیری ماشین در بیوانفورماتیک بحث خواهیم کرد و به شما نشان خواهیم داد که چگونه دانشمندان از مدلهای زبانی بزرگ برای طراحی پروتئینهای جدید و حتی کل ژنومها استفاده میکنند. در پایان، در مورد مباحث هیجانانگیز و پیشرو در بیوانفورماتیک، مانند میکروفیوئیدیک، تجزیه و تحلیل تک سلولی و کانکتومیک صحبت خواهیم کرد. این کتاب نمونههای عملی از استفاده از کتابخانههای پایتون در کار شما را ارائه میدهد. این کتاب رویکردی مبتنی بر هوش مصنوعی برای کدنویسی دارد. شما یاد خواهید گرفت که چگونه از ابزارهای هوش مصنوعی برای ارتقا، اشکالزدایی و آزمایش کد خود استفاده کنید. در سراسر کتاب، نکاتی در مورد هوش مصنوعی ارائه شده است تا به شما در پیشبرد یادگیریتان کمک کند. شما به منابع گستردهای در مورد برنامهنویسی، با تأکید بر کاربردهای عملی در محل کار، هدایت خواهید شد. همچنین شما در معرض منابع علمی بسیاری قرار خواهید گرفت تا الهامبخش کاربرد معنادار ابزارها در مسائل دنیای واقعی باشید. این ویرایش چهارم با کد مدرن، کتابخانههای جدید، رویکردها و کاربردهای جدید و فصلهای جدید در مورد جدیدترین موضوعات، بهطور گسترده بهروزرسانی شده است.
Bioinformatics is an incredibly transformative field that is drawing more and more interest in this era of computationally driven science. From its early days of developing the first sequence atlases and alignment tools to the excitement of the Human Genome Project, bioinformatics has always been a highly interdisciplinary field. It draws those passionate about using computation to advance science in ways never before achievable. this book will teach you practical methods for solving real-world problems in bioinformatics. We will cover all the major topics in bioinformatics to give you a solid foundation in each area. the book will be taught using Python, which has become the predominant language in bioinformatics. In each recipe, we’ll show you the important Python libraries and programming techniques used to solve relevant problems, and give you a wealth of resources to learn more and grow your skills. We’ll start with a gentle introduction to Python and basic data processing and data science techniques. We will then cover core algorithms in bioinformatics for genome alignment, assembly, annotation, and variant calling. Next, we’ll dive into the wealth of public databases available for bioinformatics data and learn how to navigate them. We’ll then cover important applications of bioinformatics, such as phylogenetics, metabolic modeling, and genome editing. We’ll give you a solid introduction to cloud computing and cover the major workflow systems in bioinformatics that are used to orchestrate complex pipelines. Finally, we’ll discuss the growing impact of machine learning in bioinformatics and show you how scientists are using large language models to design new proteins and even entire genomes. We’ll finish by talking about exciting frontier topics in bioinformatics, such as microfiuidics, single-cell analysis, and connectomics. this book provides practical examples of using Python libraries in your work. the book takes an AI- first approach to coding. You will learn how to use AI tools to upgrade, debug, and test your code. throughout the book, AI tips are provided to help you take your learning further. You will be guided to extensive resources on programming, with an emphasis on practical applications in the workplace. You will also be exposed to many scientific resources to inspire meaningful application of the tools to real-world problems. this fourth edition has been extensively upgraded with modernized code, new libraries, new approaches and applications, and new chapters on the latest topics.
این کتاب را میتوانید از لینک زیر بصورت رایگان دانلود کنید:
Download: Bioinformatics with Python Cookbook
نظرات کاربران